江苏商贸职业学院与20世纪初张謇先生创办的南通初等商业学校一脉相传。学校创建于1956年9月，校名为“江苏省南通区、市商业职工学校”；1960年增挂财贸干校牌子，1964年筹建“南通市半工半读商业学校”；1965年更名为“南通市商业学校”，1969年停办，1972年经江苏省委批准复办。1978年8月，经省人民政府批准，学校更名为“江苏省南通供销学校”，由省供销合作总社主管；1992年，省供销合作干部学校并入。1998年被评为省（部）级重点中专、2000年被评为国家级重点中专。2000年9月，开始举办五年制高等职业教育。2003年11月，经省教育厅批准，学校升格更名为“江苏省南通商贸高等职业学校”，增挂“江苏联合职业技术学院南通商贸分院”校牌，成为全省首批五年制高等职业学校。2013年1月，经省人民政府批准，在原江苏联合职业技术学院南通商贸分院基础上建立“江苏商贸职业学院”，同年9月招收高中毕业生，同时举办五年制、三年制高职教育。学校是江苏省供销合作社系统唯一高职院校，是“全国供销合作社示范性高等职业院校”建设单位。

学校占地面积502亩，规划总建筑面积32.9万平方米，已建约20.96万平方米；2018年在通州湾江海联动示范区科创城设立通州湾教学区（科教基地）。现设有会计与金融、经济与贸易、电子商务与物流、电子与信息、世博艺术与传媒、建筑工程与管理等6个二级学院和社科、基础、体育教学部及继续教育学院，共10个教学单位；目前开设的42个专业基本覆盖了区域现代服务业及江苏供销合作社主要产业；建有会计与金融、贸易、物流、物联网与软件、建筑工程、电子、艺术创意等实训中心，教学、科研仪器设备总值8897.24万元；至2019年8月31日，学校有教职工438人，专任教师405人，特聘教授8人，长期住校外籍教师2名，全日制在校学生8831人；建有高职发展、合作经济、农村合作金融、物联网应用技术等4个研究所，校企共建了江苏商贸通邦物流研究院，成立了通识教育中心和艺术教育中心，立项建设江苏省物联网与视觉智能处理工程技术研究开发中心；建设了大学生创新创业园；近几年毕业生就业率一直保持在98%以上。

近年来，学校先后被认定为首批全国物流职业教育人才培养基地、全国国际商务人才培养基地、国家高层次专业技术人才培训基地、江苏省商务人才培训服务平台、南通市现代服务业公共实训基地、南通市服务外包人才培训基地，先后荣获全国供销合作社系统先进集体、全国模范职工之家、全国五四红旗团委、国家级节约型公共机构示范单位、江苏省供销合作社系统先进集体、江苏省供销合作社系统创新创优先进单位、江苏省职业教育与社会教育先进单位、江苏省职业院校技能大赛先进单位、江苏省德育工作先进单位、江苏省文明校园、江苏省平安校园等称号。

进入新的发展阶段，学校正汇集政校行企各方力量，创新办学体制机制，突出内涵质量建设，全面提升核心竞争力，全力打造有特色、高水平、受欢迎的新型职业学院。