宝应县地处江苏省中部，隶属于扬州市，位于江淮之间，京沪高速纵贯南北，生态优越，风光宜人，悠久历史与现代文明交相辉映。宝应县疾病预防控制中心是由原县卫生防疫站于2004年改组而成的，其重要职责是负责全县疾病预防控制、健康教育、技术指导工作，并对重大传染病疫情、重大食物中毒和职业中毒等突发公共卫生事件进行监测、报告、控制等。
宝应县疾病预防控制中心为政府举办的全额拨款事业单位，拥有原子吸收分光光度计、全自动生化分析仪、气相色谱仪、离子色谱仪、全自动细菌生化鉴定仪等大型仪器设备，拥有江苏省检验检测机构资质认定证书，先后多次参加国家、省级科研项目，其中该中心完成的《肠道病毒71型（EV71型）灭活疫苗免疫策略研究》获江苏省医学科技一等奖。多次被江苏省卫计委、扬州市卫计委评为“疾病预防控制工作先进单位”；连续多年被县卫生主管部门表彰为“综合目标管理先进单位”。投资6200万元、建筑面积1.2万平方米的疾控中心业务用房已投入使用。
