石河子大学是国家“211工程”重点建设高校、国家西部重点建设高校和省部共建高校，是“中西部高校基础能力建设工程”和“中西部高校综合实力提升工程”（一省一校）入选高校。2017年学校入选国家“双一流”建设一流学科建设高校，2018年入选“部省合建”高校，纳入教育部直属高校排序。现有经济学、法学、教育学、文学、历史学、理学、工学、农学、医学、管理学、艺术学11大学科门类。有92个本科专业，8个一级学科博士学位授权点、26个一级学科硕士学位授权点、20种硕士专业学位授权类别、4个博士后流动站（工作站）。
石河子大学医学院现有5个“中西部高校综合实力提升工程”学科建设项目，5个省级重点学科，其中临床医学学科进入ESI全球前1%。现有硕士学术学位授权点4个（基础医学、临床医学、护理学、公共卫生与预防医学），4个硕士专业学位授权领域（临床医学硕士、护理学硕士、公共卫生硕士，口腔医学硕士）。同时，围绕感染与人畜共患病、心血管疾病与神经修复、肿瘤与代谢性疾病研究三大研究方向,建成了“新疆地方与民族高发病教育部重点实验室”，成功获批国际科技合作基地、5个省级研究中心，与北京大学心血研究所联合挂牌成立心血管研究基地。共开设临床医学、护理学、预防医学、口腔医学、医学影像学、医学检验技术6个本科专业，其中临床医学专业于2018年顺利通过认证，有效期6年。现有各类在校生7896人（其中本科学生3236人，研究生847人，留学生313人）。
